在线绘图|LinearWave Microclass 云平台，轻松进行 CCA/RDA 分析

1. 背景介绍

CCA或RDA是基于对应分析发展而来的一种排序方法，将对应分析与多元回归分析相结合，每一步计算均与环境因子进行回归，又称多元直接梯度分析。此分析是主要用来反映菌群与环境因子之间关系。RDA是基于线性模型，CCA是基于单峰模型。分析可以检测环境因子、样本、菌群三者之间的关系或者两两之间的关系。

工具链接：http://www.cloud.biomicroclass.com/CloudPlatform/SoftPage/CCA

2. 操作界面

操作界面包含任务编号、OTU丰度表、环境因子列表文件、分析类型和是否分组绘图选项，其中1和2需要上传数据，3和4只需要进行选择。

2.1. 输入文件

需要输入的文件包括OTU丰度表和环境因子列表文件，如果选择按分组进行绘图，还需要提供分组信息表，文件必须为制表符分隔的txt格式，示例文件如下。

上传文件后，点击“提交”按键即可。

2.2. 查看进程

提交任务后，点击界面右侧的“CCA/RDA历史任务”模块，可以看到任务编号、提交时间、结束时间和状态。通过点击界面“我的任务”也可以查看任务编号、软件名称和状态等信息，点击任务编号，即可查看分析结果。

在任务详情界面，展示的是任务参数、结果文件列表和在线调整图片3个区域，提供结果文件下载和图片调整功能。

3. 示例图片

4. 结果文件列表

结果文件包含CCA/RDA结果图、百分比表、样本坐标表、物种坐标表、环境因子坐标表，其中CCA/RDA结果图可以进行在线调整。

各种坐标表