PyMOL 入门教程

PyMOL软件界面介绍¶

PyMOL 软件界面如下图所示，主要由2部分组成。第一部分是菜单窗口和第二部分是显示窗口。 PyMOL2 和PyMOL1一个明显区别: 在PyMOL2中，这2部分默认是一个整体，在PyMOL1中这2部分是分开的。 在Display->Toggle Floating 可以拆分这2个窗口，快捷键是Ctrl+E, 刚开始PyMOL的界面主要是通过tkinter实现的，在PyMOL2中逐渐采用PyQT技术实现。 和PyMOL1 相比，PyMOL2 表现能力更强，功能更多，本教程以PyMOL2为例进行讲解，大部分 内容也适用于PyMOL1.

窗口1：整合了PyMOL的各个功能，主要包含如下部分

1.1 菜单窗口 1.2 操作记录显示窗口 1.3 命令输入窗口 1.4 常用命令集成面板

窗口2：分子操作和显示窗口，主要包括如下部分：

2.1 可视化窗口 2.2 命令输入窗口 2.3 分子对象列表窗口 2.4 模式窗