更新】单细胞联合 MR 筛选靶标｜衰老+NK 细胞+免疫渗透--摘要
最编程
2024-03-30 10:43:31
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- 主要数据及方法：
| Types | Notes |
|---|---|
| 转录组数据 | scRNA：GSE168522、GSE157007；Bulk：GSE63060、GSE63061 |
| 其他数据 | GWAS：ieu-b-5067、ebi-a-GCST90027158；队列数据：NHANES 1999-2002 |
| 分析方法 | 加权线性回归模型；单细胞标准流程；AUCell；CytoTRACE；拟时序分析；DREVIPlot；细胞通讯；TwoSampleMR；coloc贝叶斯共定位；CIBERSORT、MCPcounter免疫浸润 |
| 实验技术 | 单细胞采样；RNA提取和荧光定量 PCR |
- 本篇的前段研究是衰老和NK细胞，根据MR确定了CHD6作为关键基因，最后补充了一个免疫浸润。
- 设计思路逻辑也很清晰，可冲～