如何批量将 QSM 对齐到标准空间，SPM12-批量预处理数据详情

问题：

1、磁共振采集得到的磁敏感定量图像（Quantitative Susceptibility Mapping,QSM），该如何配准到标准脑空间，进而提取不同脑区的QSM值或者进行group-analysis呢？

 2、 如果是用SPM做QSM图像的配准，那能否一次处理100个数据呢？                   

对于没有工科背景的医来说，想要做到和理工科的学生一样能顺畅的进行医学图像的处理和分析基本上是不太可能的一件事情。然而，借助一些可视化的软件，进行一些简单的操作还是有可能学会的。比如以上两个问题，稍微用点心就可以自己来做分析了。

我们知道 SPM软件是分析脑功能数据的利器，很多搞认知神经科学的人都在用。如果是做fMRI分析，那么SPM肯定用的非常熟悉了，参考SPM操作手册，就可以一步一步的往下进行，做科研的医生们大概率上也能学会。 毕竟，点鼠标的事情嘛，傻瓜式的操作，大家都能学会。

那问题来了，假如你有100个被试需要分析呢，这个时候是不是要去重复100次这样的步骤呢。要是真这么去做，肯定会疯掉。那我们有什么办法可以一次性去分析这么多data呢，这个时候，我们需要用到批处理工具。

下面，我们介绍一个在磁共振成像当中经常会遇到的一个图像配准问题，来说明如何利用SPM12的批处理功能来达到我们的目的。本例中想解决的是QSM图像配置到标准空间的问题。

一般来讲，不管是什么厂家的磁共振设备，我们在得到QSM图的同时，也会有其原始数据的幅值图。这里我们以第一个回波的幅值图（也可以选择其他图像，但前提条件是必须要和QSM在同一个空间当中，且拥有和T1结构像非常接近的对比度）和QSM为例子，详细讲解这一问题该如何解决。

具体操作步骤可参考如下链接：

https://mp.weixin.qq.com/s/8dSLXcDrBNX5_hWT9iAe8g

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