进化树美化 - Evolview 基本命令快速参考和教程

EVOLVIEW能干什么？

Evolview是一款强大的进化树在线编辑软件，使用它可以制作出高颜值的进化树，网站地址为https://evolgenius.info//evolview-v2。来看几个例子吧：

操作界面

功能菜单主要分为Basic、Advanced、Annotation upload及Export四块。

操作流程及命令

1、数据准备：

该网站支持newick（常用格式）、nhx、nexus及phyloXML四种数据格式的文件。

2、导入数据：

通过MEGA等软件将进化树保存成newick格式文件，然后在Basic工具栏中点击upload tree file选项，输入project、name，然后选择要导入的文件，最后点击Submit即可完成文件的导入；

3、基础设置：

通过Basic及Advanced中的一些功能选项对进化树的字体、树形等进行个性化设置；

4、进化树美化：（英文格式输入，命令间使用tab键隔开）

1）分支颜色的设置：

点击Annotation upload选项中的树分支颜色设置按钮，输入文件name，在下方Data窗口中输入具体参数给相应分支添加颜色（具体参数可点击help查看官方详细配置说明）；

2）字体颜色设置：

点击Annotation upload选项中的字体颜色设置按钮，输入文件name，在下方Data窗口中输入具体参数给相应字体添加颜色（具体参数可点击help查看官方详细配置说明）；

3）字体背景颜色：

点击Annotation upload选项中的字体背景颜色设置按钮，输入文件name，在下方Data窗口中输入具体参数给相应字体背景添加颜色（具体参数可点击help查看官方详细配置说明）；

4）分组标记：

点击Annotation upload选项中的分组标记设置按钮，输入文件name，在下方Data窗口中输入具体参数给相应分组添加标记（具体参数可点击help查看官方详细配置说明）；

5）标签装饰：

点击Annotation upload选项中的标签装饰设置按钮，输入文件name，在下方Data窗口中输入具体参数给相应分支添加标签（具体参数可点击help查看官方详细配置说明）；

6）形状标记：

点击Annotation upload选项中的形状标记设置按钮，输入文件name，在下方Data窗口中输入具体参数给相应分支添加形状标记（具体参数可点击help查看官方详细配置说明）；

7）添加柱形图：

点击Annotation upload选项中的柱形图设置按钮，输入文件name，在下方Data窗口中输入具体参数给相应分支添加柱形图（具体参数可点击help查看官方详细配置说明）；

8）添加气泡图：

点击Annotation upload选项中的气泡图设置按钮，输入文件name，在下方Data窗口中输入具体参数给相应分支添加气泡图（具体参数可点击help查看官方详细配置说明）；

9）添加热图：

点击Annotation upload选项中的热图设置按钮，输入文件name，在下方Data窗口中输入具体参数给相应分支添加热图（具体参数可点击help查看官方详细配置说明）；

10）bootstrap：

点击Annotation upload选项中的bootstrap设置按钮，输入文件name，在下方Data窗口中输入具体参数对相应分支bootstrap数值进行展示（具体参数可点击help查看官方详细配置说明）；

11）其他：

除了以上的美化设置外，还可以展示蛋白质结构域等信息，大家可以去探索一下；

5、图形展示顺序：

可以通过左侧工具栏查看自己添加的图形，并可对其是否展示及展示顺序进行调整。而且这个网站也提供了很多例子供大家参考。

6、图形导出：

通过Export按钮进行图形导出，支持pdf/png/jpeg/tif等在内的多种格式。