如何准确掌握基因和蛋白质命名规则（注意大写与斜体的运用）
(美国LetPub编辑 : SCI论文写作系列6)
1 一般规则
· 在你的文章中使用大家都认可的基因/蛋白质的名称和符号(见下文)
· 有时认可的基因/蛋白质的名称或符号已经不再有效。这种情况下，第一次提到的基因/蛋白质，需要先列出经批准的名称，然后再添加 括号说明(以前被称为XXX)。例如，“我们使用抗POU5F1蛋白的抗体(以前称为OCT-4)...”。注意使用正确的符号，而不是以往的名称。
2 不同物种有不同的规则
- 小鼠 / 大鼠 / 鸡
(1)一般命名规则(适用于小鼠，大鼠和鸡)：
· 基因的全名不用斜体，也不用希腊字母
例如：insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子1)
· 基因符号不用希腊字母和连字符，使用斜体，第一个字母大写，其余小写
例如：Igf1 (斜体)(胰岛素样生长因子1)
· 蛋白质的名称和基因符号相同，但不用斜体，并全部大写
例如：IGF1
· mRNA和cDNA的基因符号和规定的格式
例如： "... levels of* Igf1* (italicized) mRNA increased when..."
· 首次提到的突变等位基因应该详细列出
例如：Igf1tm1Arge/Igf1tm1Arge (italicized) is one of several knockout alleles of Igf1 (italicized)
· 所有字母和数字用斜体，等位基因的符号(tm1Arge)要用上标
· 经前面详细描述之后，敲除的纯合子可表示为Igf1-/- (所有字母均用斜体，并且- / -用上标)；杂合子为*Igf1 + / - *等。
(2)对于这些命名规定的详细信息，请参阅：
· (小鼠，大鼠，鸡) http://www.informatics.jax.org/
· (专门针对大鼠) http://rgd.mcw.edu/
· MGI命名：http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/index.shtml
· 基因的MGI快速指南：
http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/short_gene.shtml
- 人类/非人类灵长类动物/家畜/ 除了小鼠、大鼠、鱼、昆虫、苍蝇外默认的其他物种
· 完整的基因名称不用斜体和希腊字母
例如：insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子1)
· 基因符号不使用希腊字母和连字符，基因符号用斜体，所有的字母用大写
例如：IGF1(斜体)
· 蛋白质的名称与基因符号相同，但不用斜体，并全部大写
例如：IGF1
· mRNA和cDNA的基因符号和规定的格式
例如："... levels of IGF1 (italicized) mRNA increased when..."
更多关于此类物种基因(突变的等位基因)命名规则和符号的网站：
http://www.genenames.org/
- 鱼(适用于所有的鱼)
· 完整的基因名称用斜体表示，全部用小写字母，不要用希腊字母
例如：cyclops(斜体)
· 基因符号用斜体，全部小写
例如：cyc(斜体)
· 蛋白质命名与基因符号相同，但仅首字母大写，也不用斜体
例如：Cyc
更多关于此类物种基因(突变的等位基因)命名规则和符号的网站：
http://zfin.org/cgi-bin/webdriver?MIval=aa-ZDB_home.apg
- 其他有用的网站：
· ExPASy(特殊蛋白质分析系统)：是瑞士生物信息学研究所(SIB)提供的蛋白质组学服务系统，可对蛋白质序列和结构以及二维PAGE进行分析：(http://au.expasy.org / )
· OMIM -孟德尔人类遗传学数据库：
(www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM )
· NCBI - Entrez Gene：提供了一个按序列和/或在NCBI's Map Viewer中查询基因的统一环境。您可以查询名称，符号，加入，出版物，GO条款，染色体数目，EC号码，和许多其他相关基因及它们的编码产物。 (www.ncbi.nlm.nih.gov/gene )
（转载请注明本文来自LetPub中文官网：www.letpub.com.cn/index.php?page=nomenclature ）
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